Ihmisillä melaniinia on ihossa, hiuksissann, silmän verkkokalvo pigmenttiepiteelissä, lisäkilpirauhasessa, sisäkorvan stria vasculariksessa, ja aivojen tietyissä osissa, kuten locus ceruleus ja substantia nigra -alueilla. Melaniini on ihmisen ihonvärin pääasiallinen määrääjä. Melaniinia tuottavia soluja kutsutaan melanosyyteiksi, ja ne sijaitsevat ihon epidermiksessä.
Albinismi on luokka geenimutaatioita, joissa elimistö ei pysty tuottamaan melaniinia.