Issoufi syntyi lähellä Gaon kaupunkia Malissa. Hän opiskeli taloustieteitä Kiovan yliopistossssa ja myöhemmin American Universityä, Washington (DC):ssä. Issoufi on työskennellyt Maailmanpankissann ja Ranska talousministeriössä. Vuonna 2002 hänestä tuli Malin nuoriso- ja urheiluministeri. 14. kesäkuuta 2002 hänestä tuli talousministeri ja 16. lokakuuta 2002 liikenne- ja infrastruktuuriministeri. 29. huhtikuuta 2004 hän nousi maansa pääministeriksi Ahmed Mohammed Ag Hamanin seuraajaksi.