Yhdistys julkaisee neljästi vuodessa ilmestyvää Skeptikko-lehteä ja myöntää vuosittaista Huuhaa-palkintoa ansioituneelle huuhaan edistäjätaholle. Skepsis on julkaissut myös paranormaaleja ilmiöitä ja valetieteellisiä väitteitä käsitteleviä kirjoja. Yhdistys järjestää kuukausittain yleisölle avoimia luentoja ja keskustelutilaisuuksia. Skepsiksellä on vakinaisesti oma osasto jokasyksyisillä rajatietoon keskittyvillä Hengen ja Tiedon messuilla.
Alusta alkaen yhdistyksen toiminta on painottunut käytännön tutkimuksen sijaan pseudotieteiden haastamiseen. Niinpä sille, joka tuottaa paranormaalin ilmiön skepsiksen järjestämissä asianmukaisissa testiolosuhteissa, on luvattu 10 000 euron palkinto. Toistaiseksi kukaan ei ole onnistunut sitä saamaan useista yrityksistä huolimatta. Vuodesta 1996 tarjolla on ollut samansuuruinen humanoidistipendi: palkinnon saa se humanoidi, joka tulee itse sitä hakemaan ja antaa samalla DNA-näytteen tai vastaavan todisteen.
Perinteisesti Skepsis on ollut tieteenharjoittajien yhdistys, mutta nykyisin mukaan on saatu myös enemmän nuoria jäseniä.
Yhdistyksen tämänhetkinen jäsenmäärä on noin 1 200.