Myös transvestiitit lasketaan sukupuolivähemmistöihin. He ovat yleensä miehiä, jotka pukeutumisellaan pyrkivät eläytymään myös vastakkaisen sukupuolen rooliin. Toisin kuin transsukupuoliset, transvestiitit harvemmin haluavat korjata juridista sukupuoltaan. Arvioidaan, että transvestiittien määrä yksistään Suomessa voidaan jo laskea kymmenissätuhansissa. Transsukupuolisuus on harvinaisempaa, ja se johtaa monesti sukupuolenkorjausprosessiin.
Sukupuolivähemmistöjen asioita Suomessa ajavat Trasek ja Seta.
Sukupuolivähemmistöjä ei pidä sekoittaa seksuaalivähemmistöihin. Sukupuolivähemmistöihin kuuluvat eivät välttämättä kuulu seksuaalivähemmistöihin, vaan sukupuolivähemmistöihin kuuluvat saattavat olla yhtä hyvin hetero-, homo- kuin biseksuaalisiakin. Täsmällistä erottelua näiden kahden käsitteen välille on kuitenkin vaikea tehdä johtuen sukupuolen käsitteen määrittelemisen vaikeudesta.
