Ensimmäinen kierros
Keväällä 2004 järjestetty ensimmäinen äänestyskierros alkoi karkauspäivänä 29. helmikuuta ja kesti kaksi viikkoa. Ääniä sai antaa joko ohjelman internet-sivuilla, puhelimella, tekstiviestillä tai postikortilla. Asiantuntijaraati oli laatinut ensimmäistä kierrosta varten 99 ehdokkaan listan, mutta äänen sai antaa myös listan ulkopuoliselle henkilölle.
Äänestyksen tulokset julkaistiin 31. lokakuuta TV1:ssä lähetetyssä ohjelmassa, jossa esiteltiin sata eniten ääniä saanutta ehdokasta. Kymmenen eniten ääniä saanutta, jotka pääsivät toiselle kierrokselle, olivat (aakkosjärjestyksessä) Mikael Agricola, Adolf Ehrnrooth, Tarja Halonen, Urho Kekkonen, Aleksis Kivi, Elias Lönnrot, C. G. E. Mannerheim, Risto Ryti, Jean Sibelius ja Arvo Ylppö. Heidän keskinäistä sijoittumistaan ensimmäisellä kierroksella ei julkistettu.
Asiantuntijaraadin laatimasta 99 ehdokkaan listasta 31 ei mahtunut sadan parhaan joukkoon, ja tilalle nousi 32 'omaa ehdokasta' eli listan ulkopuolista nimeä. Ainoa kymmenen kärkeen päässyt oma ehdokas oli Risto Ryti. Seuraavassa on lueteltu sijoille 11-100 päässeet henkilöt (ennakkolistan ulkopuolelta nousseet on merkitty tähdellä):
Ennakkolistan 99 nimestä karsiutuivat seuraavat 31:
Sadan parhaan joukossa oli muutamia erittäin kiisteltyjä nimiä, mutta kärkikymmenikköön näistä ei mahtunut yhtäkään. Matti Nykänen, Väinö Myllyrinne (kaikkien aikojen pisin suomalainen jonka puolesta käytiin humoristista internet-kampanjaa), Ville Valo ja Lalli jäivät juuri kärkikymmenikön ulkopuolelle, sijoille 11-14. Tämä herätti paljon spekulaatiota siitä, että Yle olisi peukaloinut äänestyksen tuloksia estääkseen 'epäsopivia' nimiä pääsemästä finaaliin. Yle on kiistänyt syytteet, mutta sadan parhaan listalle yltäneiden nimien saamia äänimääriä ei kuitenkaan julkaistu.
Toinen kierros
Toinen äänestyskierros alkoi 31. lokakuuta ja päättyi 5. joulukuuta. Tuona aikana Yle esitti kymmenestä finalistista puolen tunnin mittaiset tv-dokumentit, joissa joku tunnettu suomalainen toimi finalistin puolestapuhujana. Mikael Agricolaa edusti kirjailija Pirkko Saisio, Adolf Ehrnroothia toimittaja Arto Nyberg, Tarja Halosta kirjailija Kaari Utrio, Urho Kekkosta silloinen ulkomaankauppaministeri Paula Lehtomäki, Aleksis Kiveä ohjaaja Jukka Virtanen, Elias Lönnrotia muusikko Sari Kaasinen, marsalkka Mannerheimia valtioneuvos Riitta Uosukainen, Risto Rytiä toimittaja Lasse Lehtinen, Jean Sibeliusta viulisti Pekka Kuusisto ja Arvo Ylppöä kirjailija Jari Tervo.
Äänestyksen aikana julkaistiin myös kirja Suuret suomalaiset (Otava 2004), jossa on laajat artikkelit kaikista kymmenestä finalistista sekä lyhyet elämäkerralliset tiedot muista sadan parhaan joukkoon sijoittuneista.
Kilpailu huipentui itsenäisyyspäivän aattona 5. joulukuuta pidettyyn finaaliohjelmaan, jossa kaikkien ehdokkaiden puolestapuhujat ottivat yhteen panelikeskustelussa. Väittelyn jälkeen julkistettiin kilpailun tulokset. Suurimmaksi suomalaiseksi valittiin marsalkka Mannerheim, joka sai kaikkiaan 363 731 finaalikierroksella annetuista äänistä yli neljänneksen.
Tulokset:
- Carl Gustaf Emil Mannerheim, 104 244 ääntä (28,7 prosenttia)
- Risto Ryti, 80 790 (22,2 %)
- Urho Kekkonen, 57 456 (15,8 %)
- Adolf Ehrnrooth, 27 477 (7,6 %)
- Tarja Halonen, 26 536 (7,3 %)
- Arvo Ylppö, 22 136 (6,1 %)
- Mikael Agricola, 15 974 (4,4 %)
- Jean Sibelius, 15 397 (4,2 %)
- Aleksis Kivi, 7 622 (2,1 %)
- Elias Lönnrot, 6 099 (1,7 %)
Aiheesta muualla