3. marraskuuta 2006a hän erosi National Association of Evangelicals -järjestön johdosta ja pastorintehtävästään Mike Jonesin kerrottua Haggardin ostaneen häneltä seksipalveluita ja käyttäneen metamfetamiini. Alkuun Haggard kielsi tuntevansa Jonesia, mutta myöhemmin kertoi ostaneensa tältä hierontaa ja lopulta New Life -kirkon seurakunnalle osoittamassaan kirjeessä kertoi syyllistyneensä 'seksuaaliseen moraalittomuuteen'.
Teoksia
- The Life-Giving Church (2001) ISBN 0-8307-2659-4
- Dog Training, Fly Fishing, and Sharing Christ in the 21st Century (2002) ISBN 0-7852-6514-7
- Primary Purpose (1995) ISBN 0-88419-381-0
- Loving Your City into the Kingdom (1997) ISBN 0-8307-1895-8—(yhdessä Jack W. Hayfordin kanssa)
- Taking It to the Streets (2005) ISBN 0-8307-3729-4
- Confident Parents, Exceptional Teens (1999) ISBN 0-310-23339-9—(yhdessä John Bolin kanssa)
- Simple Prayers for a Powerful Life (2002) ISBN 0-8307-3055-9
- Foolish No More! (2005) ISBN 1-4000-7028-7
- Letters From Home (2003) ISBN 0-8307-3058-3
- The Jerusalem Diet (2005) ISBN 1-4000-7220-4
- Your Primary Purpose (2006) ISBN 1-59185-623-X
- From This Day Forward: Making Your Vows Last a Lifetime (2006) ISBN 1-4000-7255-7—(yhdessä Gayle Haggardin kanssa)