Son ouvrage Classification phylogénétique du vivant co-écrit avec Guillaume Lecointre cherche à faire évoluer l'enseignement de la classification en rendant celle-ci phylogénétique.
Il a participé à l'expédition Santo 2006 en tant que co-directeur.
Hervé Le Guyader s’est intéressé à l’histoire des théories de l’évolution, de la systématique, de l’anatomie et de l’embryologie comparées.
Bibliographies
- Hervé Le Guyader (dir.), L'Evolution, Belin, coll. « Bibliothèque Scientifique », 1998, .
- Hervé Le Guyader et Guillaume Lecointre (illustration Dominique Visset), Classification phylogénétique du vivant, Belin (avec le concours du Centre national du livre), 2001 . La troisième édition (revue et augmentée) a été publiée en 2006 .
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