Définie à l'origine comme l'« océanographie des lacxs », la représentation moderne de la limnologie est la « science des eaux superficielles continentales ou intérieures » (eau douce ou salée, stagnante ou mouvante, dans les lacs, rivières, marécages...). Cette définition en étend son domaine de compétence aux eau courantes, ce qui a l'avantage de rendre compte de la solidarité du réseau hydrographique de surface. La limnologie fait intervenir, au même titre que l'hydrologie, des études physico-chimiques et biologiques.
(source : http://www.thonon.inra.fr/bassinversant/restaurationlacs/limno-def.htm
)
Le terme « limnologie » trouve sa racine dans le grec limne (lac), ou logos (étude). François-Alphonse Forel (1841-1912) en fut le précurseur avec son étude du Lac Léman.