De største byene langs Limfjorden er Aalborg, Skive, Thisted og Nykøbing. Ved den vestlige munninga ligger fiskerihavnen Thyborøn. Største øy er Mors. Det finns broer ved Oddesund, Sallingsund, Vilsund, Aggersund og i Aalborg, en demning ved Virksund, en motorveistunnel ved Aalborg samt flere små ferger.
Fisket i Limfjorden har gått meget tilbake, men ett viktig produkt er fremdeles muslinger som skrapes i fjorden og foredles i Glyngøre og Nykøbing.
Limfjorden var opprinnelig en fjord, men 3. februar 1825 brøt en stormflod gjennom den smale landstripa i vest og dannet Agger Kanal (siden Thyborøn Kanal).
