Til tross for at han tidligere var medlem av det sørafrikanske kommunistpartiet har han i stadig større grad blitt assosiert med nyliberalistisk økonomisk politikk, og regnes som arkitekten bak det sørafrikanske økonomiske reformprogrammet GEAR som har vært offisiell regjeringspolitikk siden 1996.
Internasjonalt har han også blitt kjent for sitt kontroversielle syn på AIDS, han støtter seg til en mindre gruppe vitenskapsmenn som mener at HIV-viruset ikke forårsaker AIDS. I stedet har han ved flere anledninger antydet at de helsemessige konsekvensene ekstrem fattigdom fører med seg, som f.eks underernæring, kan være en av årsakene til sykdommen.