Gift år 1538 med Margareta Pedersdotter (Bielke) född 1510.
Barn:
- Peder Banér (Axelsson) (år 1540 - år 1565)
- Sten Banér (Axelsson) (år 1546 - år 1600, avrättad vid Linköpings blodbad) )
- Gustaf Banér (Axelsson) (år 1547 - år 1600, avrättad vid Linköpings blodbad)
- Per Banér (Axelsson)