Jandarbijev ledde den tjetjenska delegation som i maj 1996 mötte ryske presidenten Boris Jeltsin och ryske premiärministern Viktor Tjernomyrdin i förhandlingar om läget i Tjetjenien. Förhandlingarna slutade med en överenskommelse om eldupphör 27 maj samma år. I presidentvalet nästföljande år besegrades Jandarbijev av Aslan Maschadova. Senare anslöt sig Jandarbijev till den islamistisk opposition som bekämpade Maschadov.
Under åren har Jandarbijev oftast befunnit sig utomlands, i försök att uppbåda stöd från utländska islamistgrupper. I februari 2004 befann han sig i Doha, huvudstad i Qatar, och dödades då av en bilbomb.
